Wenn radioaktive Abfälle transportiert werden, fällt dies in den Aufsichtsbereich des ENSI. Die Sicherheitsmassnahmen für solche Transporte unterstehen strengen nationalen und internationalen Auflagen.
Der Transport von radioaktiven Abfällen kann sowohl auf der Strasse als auch auf dem Schienenweg erfolgen. Dazu werden spezielle Behälter verwendet, die einerseits die Umgebung vor Strahlung und andererseits das darin befindliche Material schützen. Internationale Vorschriften und Richtlinien des ENSI regeln die Auslegung, Herstellung und Verwendung von solchen Transport- und Lagerbehältern.